2005/06/24 (金)
◆ ベイジアン系統推定とモデル選択 - 12:25:03
MrBayesではpartition毎にかなり自由にパラメータをバラバラにできるので、じゃぁpartition毎にモデル選択もして、全体で一つのパラメータのモデルと比較してモデル選択をすべきやないか、ということで先日から悩んでいたわけですが、こちらは北大のK保セソセイからご教示いただき、BICをどう扱うかが解決。結論としてはpartition毎にモデル選択基準を算出して和を採るのではなく、尤度の和とパラメータ数の和とサンプルサイズの和からBICを計算しないといけない、ということ。まー、なんというか、感覚的なものなので説明しろと言われても困るけど。
◆ Parametric Bootstrapとは - 11:53:46
粕谷セソセイの解説キターー! いや、すごくよくわかりました。あー大体こんな感じかなというところまで来ていたのですが、名前が邪魔をして「氷解」に至らなかったのですが、おかげさまでようやく到達できましたよ!
◆ Modeltest 3.7 - 00:58:30
塩基置換モデル選択用ソフトModeltestがバージョンアップしています。今回のバージョンからBICの算出に対応したようです。