幾霜::残日録::2008/07/02 (水)

　Majestouch Tenkeyless 茶軸 US-ASCII配列版を発注しました。あー楽しみ。FKB8579に取って代わることはできるか。

　こちらも実際のデータを用いてギャップ情報の付加の影響を調べている。ベイズ推定の場合はSICを使っているのは先ほどのものと同じ。当てはめているモデルは形質状態頻度を組み込んだモデルである。形質状態頻度を組み込んでいないモデルでどうなるかは検証していない。

　ギャップ情報を加えることが系統推定結果にどのような影響を及ぼすのかを8領域のデータを用いた解析から調べている。ベイズ推定で用いているギャップ符号化方法はSimple Gap Coding (Simple Indel Coding, SIC)である。最節約法ではModified Complex Indel Codingとギャップを第5形質として扱う方法も用いている。ベイズ推定では形質状態頻度を組み込んだモデルを使ったのかどうかはよく分からない。

追記 - 10:34:57
　HKYをHasegawa, Kishino, Yangと書いている痛いミスを発見。まぁ確かにそう思うのも無理は無いかもしれませんが、Yanoさんに失礼ですよ。っつーかレフェリー気付けよ。引用文献リストではどうなっているかと確認したが、HKY85は引用として扱っておらずリストには入っていなかった。