幾霜

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2008/07/09 (水)

[Hardware] GX200実写速報のノイズを見て萎えた - 21:44:32

 ISO64でも気になる・・・。話にならん。

2008/07/07 (月)

[Topics] ウィンブルドン男子シングルスはナダルがフェデラーを破る - 16:49:44

 歴史に残る死闘ですねぇ。あーくそ見たかったなぁ。そんな時間ねぇーー。

2008/07/06 (日)

[Life] 古生物学会終了 - 16:16:33

 定量化とか統計解析とかの無視っぷりがスゴイ。あそこまで徹底しているといっそ潔ささえ感じてしまう。まぁちゃんと根拠が書いてあれば専門家にとってはどの程度信用できるのかは判断できるんでしょうけど、その辺りをきちんとやっている人がかなり少ない印象でした。ま、定量化・統計解析しようのないことがあるのは理解できるんですが。

 講演中での専門用語の使い方も気になりました。かなり狭い専門分野内での用語を平然と使うので、そこで躓くともうその先は理解不能。古生物学っつったってそれなりに広い分野なので、もう少し配慮した方が良いのではないかと思います。固有名詞とか分かるわけないっつーの。

2008/07/05 (土)

[Life] 数値流体解析すげー - 21:30:04

 スピリファー(腕足類)の数値流体解析で、あの殻形態が流れに対してどのような効果を生むのかを調べている研究は非常にすばらしくて古生物学の底力を感じさせられました。いやーいい研究してますねSIN君。静大時代にはここまで大化けするとは思っていませんでしたよ。プレゼンもうまいし、あとは論文にするだけですな。

[Life] 酔っ払い - 21:26:29

 うおぇ〜。

 久しぶりに古生物屋の皆様に混じって飲みに行った。「居酒屋 左五平」へご案内して2時間16人でガバガバ。支払いはT大のTNB先生が全額あっさりカードで負担。流石だ。まぁその後、定職に就いている方々はお金を出していましたが、学生はタダだった。いやぁ貧乏人にとっては大助かりでした。その後一部の方は二次会に行かれたようです。私はすでにフラフラになってしまったので早々に退散してきました。明日もあるしね。

[Life] 古生物学会 - 13:08:59

 昨日は片平、今日から青葉山にて古生物学会。

 しかし、盛大に寝坊してしまった。まだ自宅。会長講演を聞き逃してしまった。残念。

2008/07/04 (金)

[Life] ミラーリングしてて良かった - 23:15:32

 ミラーリングを解除して各ドライブでchkdskしてみたところ、プライマリのドライブでバッドクラスタがぼろぼろと見つかった。あーあ、もう逝ったか。保証期間内で良かったよ。

[Life] うひょー - 21:46:57

 良い結果が出た。これでHDDがぶっ飛んだり、文章を書き起こすのが間に合わなかったりしない限りは5章構成(げねらるいんとろとでぃすかっしょんは含まない)で毒論が出せるはずである。まずはHDDを交換してからけがに注意、かな。

 そういえば進化学会の締め切りも近い。どの話をすべきか迷う。せっかくだし一番新しい話にするか?

[Science|Software] コピペすれば問題無いのにsource("filename")ではsink()によるファイル出力が動作しない - 21:05:52

 なんでだ?

[Life] 微速前進 - 16:59:28

 ちょっとずつげねらるいんとろを執筆。2ページくらいで終わりそう(笑)。短けーなー。十分だと思うんですけどねぇ。

[Science|Software] anova(glm(), test="Chisq")後のPost-hoc testってどうやんの? - 05:43:36

 わからんぞぉー。

追記 - 06:07:42
 multcompパッケージで簡単にできた。足軽日記さんの通りにやる。と言っても私はlmer()ではなくglm()でやってますが。

[Life] HDDの調子が悪い? - 01:01:26

 なんか再起動する度にディスクチェックが走るんですけど・・・。激しく不安だ。なんで毒論執筆中に限ってこういうことが起きるかね。っつーかミラーリングはどうした?

2008/07/03 (木)

[Software] 欧文と和文でフォントを変えられるエディタは無いのか? - 22:04:56

 っつーか秀丸でできないんだろうか。下のFontLinkでやるやり方では和文フォントのレンダリングが汚くて耐えられない。しかし、欧文フォントにはConsolasを使いたい。困った。他のエディタでできても秀丸から移るのは至難やしなぁ。

[Software] ConsolasフォントとM+1VM+IPAG-circleをFontLinkする - 16:16:18

 M+2VM+IPAG-circleをFontLinkして使っている方がやり方を公開してくださっていたのでマネしてM+1VM+IPAG-circleとFontLinkしてみました。秀丸でのコーディング中にBitstream Vera Sans Monoはイマイチだなとずっと我慢していたので感動。素晴らしい。

 やり方はVisual Studioのインストール後にConsolas Font Packをダウンロード・インストールし、regeditでHKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows NT\CurrentVersion\FontLink\SystemLinkに文字列値「Consolas」を作成して値を「M+1VM+IPAG-circle.ttf,M+1VM+IPAG circle」にするだけ。その後、再起動すれば有効になっています(ログオフ・ログインでもいいかもしれませんが)。

 このFontLinkして足りない文字はM+で補完するようにしたConsolas、視認性は素晴らしいのですが、文字サイズによっては日本語の文字が横長になってしまいます。おそらくフォントレンダリング時にConsolasのレンダリングパラメータで漢字フォントをレンダリングしてしまっているのではないかと思いますが、これさえなんとかなれば完璧なんですけどねぇ。IPAゴシックとリンクさせてみようかな。同じ結果になるような気もしますが。

[Life] 角さん被引用3件目 - 02:40:43

 角さん引用論文を新たに一つ発見。よしよし。次もいっぱい引用されると良いなぁ。でも角さんよりだいぶ玄人好みの仕様・・・要するに素人お断りなUIなのが難。マニュアルやハンドブックを早く書ききらないといけませんな。

2008/07/02 (水)

[Hardware] 狩ってしまった - 23:48:33

 Majestouch Tenkeyless 茶軸 US-ASCII配列版を発注しました。あー楽しみ。FKB8579に取って代わることはできるか。

[Science] Incorporation of gap characters and lineage-specific regions into phylogenetic analyses of gene families from divergent clades: an example from the kinesin superfamily across eukaryotes - 10:10:22

 こちらも実際のデータを用いてギャップ情報の付加の影響を調べている。ベイズ推定の場合はSICを使っているのは先ほどのものと同じ。当てはめているモデルは形質状態頻度を組み込んだモデルである。形質状態頻度を組み込んでいないモデルでどうなるかは検証していない。

[Science] Incorporating gaps as phylogenetic characters across eight DNA regions: Ramifications for North American Psoraleeae (Leguminosae) - 09:53:59

 ギャップ情報を加えることが系統推定結果にどのような影響を及ぼすのかを8領域のデータを用いた解析から調べている。ベイズ推定で用いているギャップ符号化方法はSimple Gap Coding (Simple Indel Coding, SIC)である。最節約法ではModified Complex Indel Codingとギャップを第5形質として扱う方法も用いている。ベイズ推定では形質状態頻度を組み込んだモデルを使ったのかどうかはよく分からない。

追記 - 10:34:57
 HKYをHasegawa, Kishino, Yangと書いている痛いミスを発見。まぁ確かにそう思うのも無理は無いかもしれませんが、Yanoさんに失礼ですよ。っつーかレフェリー気付けよ。引用文献リストではどうなっているかと確認したが、HKY85は引用として扱っておらずリストには入っていなかった。

a-News 2.11 "eve" 20051224

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