幾霜

RSS / Last Update : 2019/02/18 07:52:17

移籍先を探しています。系統樹推定法やメタバーコーディング法などに詳しい研究者を探している方がおられましたらご一報下さい。

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2019/02/18 (月)

[Bicycle] ゴッドハンド ワイヤーカッター - 07:52:17

 インナー&アウターケーブルをきれいにカットできるカッター。これで切ってから、千枚通しとか同様の形状のヤスリとかで断面形状を整えてワイヤリングすることで、シフト・ブレーキの引きが軽く、長寿命になります。既にワイヤーカッターを持っていても買い換える価値が十分にあります。

[Bicycle] 日泉ケーブルインナー&アウターケーブル - 07:49:38

 昨年を振り返る記事。

 噂を聞いて購入しました。コーティングもないインナーと見た目普通のアウターケーブル。すごいの一言。内部にはシリコングリスを入れていますが、ブレーキやシフトの引きが軽い。シマノのポリマーコーティングよりも軽い。その上、コーティングに依存していないので、コーティングの剥がれによって引きが重くなる現象が起きない。内部に水が入れば錆びるかもしれませんが。機械式のリムブレーキを使う限りにおいては最高の製品だと思います。

2019/02/05 (火)

[Life] これから一人暮らしする人へ家電購入のアドバイス - 20:00:28

 もうすぐ春なので、これから初めての一人暮らしをする方も多いかと思います。ただ、一人暮らしだと人手が劇的に減りますから、暮らしの手間暇を減らす道具を揃えることは効率的な一人暮らしには必須です。1度買えば当分使えますから、ケチケチせずに奮発しましょう。では、以下はおすすめの家電リストと理由です。

熱風乾燥機能付き洗濯機
 ないと死ぬ。熱風ではなくただの外気温と同じ温度の風が出る送風乾燥機能付きもありますが、そんなのでは駄目です。熱風乾燥機能付きならふわふわにできます。急ぎの洗濯物も一晩で乾かせます。高機能なやつなら1時間で乾かすことも可能です(ただし一人暮らしには大袈裟だと思うし一人暮らしの部屋には設置できない可能性が高いので注意)。価格コムのリストになってますので、予算と設置スペースで選んでください。私が自宅で使用しているのは、シャープ製の一番小さいタイプです。

LEDセンサーライト
 玄関の外や内側が電球タイプなら、電球型LEDセンサーライトに置き換えましょう。トイレに設置するのも良い。スイッチはONにしっぱなしにしておきます。夜帰宅すれば自動で点灯します。スイッチを探す手間がありません。安全にもなります。超絶便利です。安物はまともに動作しないので、最初からパナソニック製のLEDセンサーライトにするのがおすすめです。それ以外の企業の製品はセンサーの出来が悪くてまともに動作しませんでした。

庫内容量18L以上のオーブンレンジ
 コンビニ弁当とかが何の心配もなく入る。ターンテーブルなしでフラットなタイプにしておくと掃除が楽。飲み物を指定温度まで温める機能とかがあって冬場に温かいものが飲みたいとき助かります。2杯以上なら電気ケトルの方がおすすめですが、1杯だけなら電子レンジの方が早くて楽。また、水ではなく牛乳を温めたりするのも、電気ケトルではやりたくないですが、電子レンジなら気兼ねなくできます。

電気ケトル
 保温機能のあるポットはやめましょう。水がまずくなるし、沸くのは遅いし、掃除も面倒です。転倒しても漏れないとか、外側が熱くないとか、蒸気が出ないとか、そういうのもありますし、温度を指定できるタイプもありますので、用途に応じて選びましょう(全部入りはたぶんありません)。私はリコルテの50〜100℃まで5℃刻みで設定できるものを使用しています。お茶を入れるので50℃に設定できるのは重要です。下限が70℃とかの製品もあるので注意しましょう。

除湿機
 部屋干し用です。エアコンでも構いませんが、少なくともどちらかは使います。乾燥機があっても、シャツやアウター、ズボンはしわくちゃになるので乾燥機は使えません。そういうときはハンガーにかけて形を整えた状態で除湿機の風を当てると良い具合に乾きます。アイロンかけるなら乾燥機でも構いませんが、一人暮らしではアイロンがけもできるだけ避けたいので、この方法が手抜き手法としてはベストな気がします。

フィリップスかブラウンの電動歯ブラシ
 両社製品は非常に性能が高く、かつサードパーティの互換ブラシが出ているのでランニングコストが低い。他社だと純正品しかなかったりするのでランニングコストが高くなります。私はフィリップスのソニッケアーを愛用しています(ただし、モーターが劣化するので長持ちはしません)。

ボディシェーバー
 ズボラなのでやりたくないのですが、ムダ毛はしばしば本当にじゃまになるのでときどき剃っています。今はパナソニックのER-GK60というのを使っていますが、風呂に入る前にさっとできるので便利です。脱毛やひげ剃りの前処理にも使えます(事前にこれで処理しやすい長さに揃えられる)。

サーキュレーター
 寝苦しい夏の夜にも使えるし、エアコンの暖気が上層に滞留してしまう冬場にも使えるので、一つ持っておくと便利。

電気毛布・電気ひざ掛け
 冬場、エアコンやヒーターを使わずにこれらで済ませると電気代が抑えられる。電気毛布は極寒の夜に寝るときすごく快適になるので寒い地域では必須。極寒地域だと夜間もFF式ストーブで室内を温めているのでむしろ不要になるかもしれませんが。

 ここからは調理家電。自炊しないなら不要。

電気オーブン
 ガス使えるならガスオーブンの方がいいですが、電気だと設置場所を選ばないメリットはあります。オーブンレンジでは駄目なのかと思われるでしょうが、料理していると電子レンジとオーブンを同時に使いたくなってくるので、両方要るんです。庫内容量がそれなりに大きく、低温(60℃くらい)〜高温(250℃くらい)まで温度設定できるものが望ましい。ただし、別途温度計は必要です。

ハンドブレンダー
 私はブラウンのものを使用しています。ミキサー、ハンドミキサー、フードプロセッサーの役割が一つでこなせますので、バラバラに買うよりコスパが良いです。プロならそれぞれバラバラの品の方が良いでしょうけど。アタッチメント多めの上級品にしておくのが吉。

 あと、家電じゃないですがガラス製のボウルは持っておくと料理が楽になります。金属製だと電子レンジにかけられないですが、ガラスだと電子レンジで温められるので、湯煎とかしなくていいのです。

2019/01/29 (火)

[Science] サーマルサイクラーのヒートリッドとプレートシール - 02:19:17

 96ウェルプレートにはプレートシールを貼りますが(シリコンマットもあるけどコンタミ防止の観点から却下)、よく蒸気漏れしていました。それで仕方なくキャップを使用していました(これだと漏れない)。しかし、今所属している研究室にあるABIのSimpliAmpという機種だと、安物のアルミテープを雑に貼っただけでも全く蒸気漏れしないんですわ。感動。ヒートリッドの形状が良いのだと思う。ABIスゲー。なので、安物のアルミテープが使えるSimpliAmpはランニングコストが安く済み、長く使えば結果として一番安いんですよね。今はシリコンゴムシートとかでこのABIマジックを他社製サーマルサイクラーでも再現できないか試行錯誤しています。が、今のところうまく行っていません。

2019/01/28 (月)

[Science] Pipetty - 19:17:18

 昨年、研究室で購入してもらった電動ピペット。20μL・250μL・1000μLの3つありますが、250μL(チップは200μL用を使用)は精度は落ちますが10μL以下を分注することが可能で、PCRの際にミクスチャーを連続分注することで大幅に時間を短縮できます。「多めに出る」ので、実際に分注したい量よりも若干少なめに設定します(ばらつきは少ない)。以前はエーアンドディーのMPAシリーズを使用していましたが、こちらの方が精度が高いように感じています。ただ、MPAシリーズは充電スタンドがあるのでその点では便利です(Pipettyはニッケル水素単4電池)。

2019/01/20 (日)

[Bicycle] Wilier Triestina GranTurismoR Team - 23:28:54

 昨年を振り返る記事1本目。

 昨年、某海外通販サイトでイタリアWilier TriestinaのGranTurismoR Teamというロードバイクフレームがありえない価格で販売されていた。日本で正規に購入する価格の半額以下である。カラーは完全に気に入ったとは言えなかったが、悪くはなかった。なのでポチった。実は、正月のセールでUltegra R8000のコンポも既に持っていたので、あまり他のパーツを集めなくても手持ちだけで1台組める状況だったこともあった。それで組み上げて乗ってみると、恐ろしく疲労が少ないすごいフレームであった。重量は軽くないが(しかも公式スペックは詐欺である)、長距離を走っても疲労が溜まらない点で十分に満足の行くものでした。今だと私の好きなRidleyのFenix SLが安く買えるのでそちらにするでしょうが(そちらの方がずっと軽いし)、非常に良い買い物だったと言えるでしょう。今年はこのバイクでビワイチするのが目標です。

2019/01/19 (土)

[Life] 毎日鍋 - 20:53:40

 年末年始で学内の食堂や売店が空いていなかった期間に、事前に買い出ししてきて鍋をやるようになった。現在は食堂や売店は平常営業に戻っているが、鍋は続いている。この部屋では魚料理を禁止されている(魚の環境DNA研究をしているのでコンタミ源になるからだ)ので、毎日豚肉や鳥つみれ鍋にしている。今日は40個598円のチルド餃子を買ってきて、半分使ってそのうちの半分を焼餃子、残り半分を鍋に投入した。来年度からは食事の確保が面倒なところに移籍するので、予行演習みたいなものか。あちらの調理器具環境がまだわからないので、自炊できるのかどうかわからないけれど。

2019/01/07 (月)

[Science] Paper of the year 2018 - 19:29:29

 昨年の中で最も感銘を受けた論文を紹介します。

Using archived television video footage to quantify phenology responses to climate change
 欧州の伝統ある自転車レース、「ツール・デ・フランドル」(ロンド・ファン・フラーンデレン)の映像アーカイブから植物のフェノロジーを読み取り、気候変動の影響を明らかにした論文。

HiMAP: Robust phylogenomics from highly multiplexed amplicon sequencing
 ゲノムまたはRNA-seqデータのある生物群の単一コピー遺伝子を探索し、多重整列してユニバーサルプライマーを作成してくれるパイプライン。これを使えば容易に対象分類群の単一コピー遺伝子用ユニバーサルプライマーが大量に作成できる。それを使って増幅し、産物を高スループットシーケンサで解読して繋げれば、高解像度・高信頼性の系統樹が比較的安価に得られる。

 以下はその他に記憶に残った論文のリストです。

Large-scale ocean connectivity and planktonic body size

Functional diversity and community assembly of river invertebrates show globally consistent responses to decreasing glacier cover

Retrieval of a million high-quality, full-length microbial 16S and 18S rRNA gene sequences without primer bias

Competition-colonization tradeoffs structure fungal diversity

How sea-level change mediates genetic divergence in coastal species across regions with varying tectonic and sediment processes

Mycorrhizal fungi mediate the direction and strength of plant–soil feedbacks differently between arbuscular mycorrhizal and ectomycorrhizal communities

Late Miocene–mid-Pliocene tectonically induced formation of the semi-closed Japan Sea, inferred from seawater Nd isotopes

Ocean currents and herbivory drive macroalgae-to-coral community shift under climate warming

High-resolution modeling of thermal thresholds and environmental influences on coral bleaching for local and regional reef management

Bayesian Divergence-Time Estimation with Genome-Wide Single-Nucleotide Polymorphism Data of Sea Catfishes (Ariidae) Supports Miocene Closure of the Panamanian Isthmus

Morphological and ecological adaptation of limpet-shaped top shells (Gastropoda: Trochidae: Fossarininae) to wave-swept rock reef habitats

Comparative phylogeography of diadromous and freshwater daces of the genus Tribolodon (Cyprinidae)

A generalist herbivore requires a wide array of plant species to maintain its populations

A Sequel to Sanger: amplicon sequencing that scales

Clustering huge protein sequence sets in linear time

MUMmer4: A fast and versatile genome alignment system

EukRef: Phylogenetic curation of ribosomal RNA to enhance understanding of eukaryotic diversity and distribution

fastp: an ultra-fast all-in-one FASTQ preprocessor

Simple statistical identification and removal of contaminant sequences in marker-gene and metagenomics data

[Life] あけましておめでとうございます。 - 19:12:39

 今年もよろしくお願いします。昨年は途中で力尽きて更新を止めてしまいましたが、今年こそということで今日から再開します。

a-News 2.11 "eve" 20051224

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