2019/01/07 (月)
◆ [Science] Paper of the year 2018 - 19:29:29
昨年の中で最も感銘を受けた論文を紹介します。
Using archived television video footage to quantify phenology responses to climate change
欧州の伝統ある自転車レース、「ツール・デ・フランドル」(ロンド・ファン・フラーンデレン)の映像アーカイブから植物のフェノロジーを読み取り、気候変動の影響を明らかにした論文。
HiMAP: Robust phylogenomics from highly multiplexed amplicon sequencing
ゲノムまたはRNA-seqデータのある生物群の単一コピー遺伝子を探索し、多重整列してユニバーサルプライマーを作成してくれるパイプライン。これを使えば容易に対象分類群の単一コピー遺伝子用ユニバーサルプライマーが大量に作成できる。それを使って増幅し、産物を高スループットシーケンサで解読して繋げれば、高解像度・高信頼性の系統樹が比較的安価に得られる。
以下はその他に記憶に残った論文のリストです。
Large-scale ocean connectivity and planktonic body size
Competition-colonization tradeoffs structure fungal diversity
Ocean currents and herbivory drive macroalgae-to-coral community shift under climate warming
Comparative phylogeography of diadromous and freshwater daces of the genus Tribolodon (Cyprinidae)
A generalist herbivore requires a wide array of plant species to maintain its populations
A Sequel to Sanger: amplicon sequencing that scales
Clustering huge protein sequence sets in linear time
MUMmer4: A fast and versatile genome alignment system
◆ [Life] あけましておめでとうございます。 - 19:12:39
今年もよろしくお願いします。昨年は途中で力尽きて更新を止めてしまいましたが、今年こそということで今日から再開します。